Επίσημη απάντηση του CDC FOIA επιβεβαιώνει ότι η επικύρωση του γονιδιώματος του SARS-CoV-2 δεν έχει ολοκληρωθεί σύμφωνα με τα επιστημονικά πρότυπα!
Το CDC δεν είναι σε θέση να επαληθεύσει επιστημονικά το πλήρες γονιδίωμα του SARS-CoV-2, αφήνοντας πιθανότητα για ημι-τυχαία κατασκευή.
... στην οποία ζήτησα αρχεία σχετικά με αυτά τα τέσσερα σημεία :
Αρχεία σχετικά με την αλληλούχιση ενός ιού του SARS-CoV-2 που διασφάλιζαν ότι ο ιός απομονώθηκε φυσικά από οποιοδήποτε άλλο γενετικό υλικό πριν από την αλληλούχιση.
Αρχεία μιας ενιαίας αλληλουχίας (μακράς) ανάγνωσης από την πρώτη θέση [...] έως την τελευταία θέση [...] του γονιδιώματος. [..]
Καταγραφές ενός τέλεια συναρμολογημένου contig [...] από έναν μεταγονιδιωματικό συναρμολογητή όπως το Megahit (όπως χρησιμοποιείται από τους Wu et al, 2020) [...].
Καταγραφές διαδικασιών RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) που διενεργούνται σε δείγμα ασθενούς ή σε καλλιέργεια ιού [...]
Το CDC δήλωσε ότι δεν έχει τη δυνατότητα να απομονώσει ένα μόνο ιό από όλο το υπόλοιπο γενετικό υλικό που υπάρχει σε ένα δείγμα και ότι δεν διαθέτει αρχεία που να αποδεικνύουν ότι αυτό έχει πραγματοποιηθεί ποτέ ή ότι είναι καν δυνατό.
Ανέφεραν επίσης ότι δεν διαθέτουν ούτε έχουν γνώση οποιασδήποτε μεμονωμένης ανάγνωσης ή πλήρους συναρμολόγησης που θα επιβεβαίωνε μαθηματικά το πλήρες γονιδίωμα ενός ιού.Επιπλέον, το CDC βασίστηκε αποκλειστικά σε δημόσια διαθέσιμα δεδομένα αλληλουχιών και δεν χρησιμοποίησε την τεχνική RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) για να επαληθεύσει τα χειροκίνητα αναγνωρισμένα άκρα του γονιδιώματος από Κινέζους ερευνητές.
Η επαλήθευση αυτών των άκρων είναι ζωτικής σημασίας, καθώς η παρουσία πρόσθετων βάσεων πέραν της πρώτης και της τελευταίας θέσης του γονιδιώματος αναφοράς θα υποδήλωνε ότι η ενίσχυση RACE δεν καταγράφει τις πραγματικές τερματικές αλληλουχίες.
Παρόλο που δεν έχουν δημοσιευτεί δεδομένα για τα (ενισχυτικά) amplicon RACE για τον SARS-CoV-2, τα ευρήματα από τους ίδιους ερευνητές που μελέτησαν τον ιό RaTG13 υποδηλώνουν ότι αυτό μπορεί να συμβαίνει, υπογραμμίζοντας την ανάγκη για ανεξάρτητη επικύρωση.
Η αλληλούχιση μακράς ανάγνωσης δεν έχει ακόμη καταδείξει πειστικά την πλήρη αλληλουχία του γονιδιώματος, καθώς τα σφάλματα και τα ελλείποντα άκρα της αλληλουχίας εμποδίζουν τη δημιουργία ενός γονιδιωματικού μοντέλου υψηλής αξιοπιστίας.Η προσέγγιση του γραφήματος De Bruijn για τη συναρμολόγηση σύντομης ανάγνωσης μπορεί να δημιουργήσει πολλαπλά υποψήφια γονιδιώματα συνδυάζοντας διάφορα τμήματα γενετικού υλικού. Αυτό εγείρει την πιθανότητα ότι το γονιδίωμα του SARS-CoV-2 θα μπορούσε να είναι, ένα ημι-τυχαίο κατασκεύασμα, που σχηματίζεται μέσω του ανασυνδυασμού γενετικών αλληλουχιών με τη χρήση αυτής της μεθοδολογίας.
Η υπόθεση αυτή παραμένει αδιαμφισβήτητη, καθώς το γονιδίωμα αναφοράς δεν έχει ποτέ αλληλουχηθεί πλήρως από την αρχή έως το τέλος, ούτε έχει συναρμολογηθεί με τη μέθοδο overlap-layout-consensus (OLC), η οποία θα μπορούσε ενδεχομένως να προσφέρει μεγαλύτερη εμπιστοσύνη στο γονιδίωμα αναφοράς.Μπορείτε να δοκιμάσετε πώς λειτουργεί η προσέγγιση του γραφήματος De Bruijn, στο διαδικτυακό μου εργαλείο στη διεύθυνση - X thread
Ενημερώστε με για τις σκέψεις σας στα σχόλια!
Πηγή - Μετάφραση/διαμόρφωση : Α.Τ.
🫴🏻 ©ΑΝΑΤΡΟΠΗ ΤΩΡΑ - © Ε.Α.Π.Κ. - © Ε.Α.Ζ.Ι. Trust : Substack Σημειώσεις • Τelegram • Facebook • Greek Face • Χ